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日本東京大學(xué)和國立癌癥研究中心日前聯(lián)合發(fā)布新聞公報說,,兩家機(jī)構(gòu)的研究人員利用一種新的基因組分析法,,快速且全面地檢測出兒童白血病的基因組異常。
基因組分析對于癌癥的精準(zhǔn)診斷,、確定治療靶點非常重要,。日本研究人員利用納米孔測序儀的自適應(yīng)采樣技術(shù)進(jìn)行測序,然后處理和分析所獲數(shù)據(jù),。納米孔測序儀能進(jìn)行長讀長測序,,即讀取更長的脫氧核糖核酸(DNA)片段,與常規(guī)測序技術(shù)相比,,在解析復(fù)雜的基因組結(jié)構(gòu)方面具有獨特的優(yōu)勢,。自適應(yīng)采樣則是一種實時動態(tài)調(diào)整采樣率的方法,使得采集的樣本更具有代表性,。
研究人員分析了28個兒童白血病病例的基因組數(shù)據(jù),,以驗證其有效性。結(jié)果顯示,,28個病例中有24例檢測出了重要基因組變異,,其中12個病例是以往方法難以檢測出的基因組結(jié)構(gòu)異常。此外,,以往測序技術(shù)耗時長,,從提交樣本到結(jié)果返回需要超過一個月時間,而新的基因組分析法72小時就能獲得結(jié)果,。
公報說,,本項研究構(gòu)建的分析方法應(yīng)用范圍廣泛,,還能用于藥物代謝相關(guān)的基因詳細(xì)分析,還可檢測出可成為治療效果指標(biāo)的基因組變化,。不過,,與現(xiàn)有測序技術(shù)相比,自適應(yīng)采樣在檢測單核苷酸變異,、小片段基因的插入和缺失方面并不具備優(yōu)勢,。研究人員計劃通過完善分析軟件等方法提高成功率。
本項研究相關(guān)成果已發(fā)表于新一期《血癌雜志》上,。
(記者錢錚)
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日本東京大學(xué)和國立癌癥研究中心日前聯(lián)合發(fā)布新聞公報說,兩家機(jī)構(gòu)的研究人員利用一種新的基因組分析法,,快速且全面地檢測出兒童白血病的基因組異常,。
基因組分析對于癌癥的精準(zhǔn)診斷、確定治療靶點非常重要,。日本研究人員利用納米孔測序儀的自適應(yīng)采樣技術(shù)進(jìn)行測序,,然后處理和分析所獲數(shù)據(jù)。納米孔測序儀能進(jìn)行長讀長測序,,即讀取更長的脫氧核糖核酸(DNA)片段,,與常規(guī)測序技術(shù)相比,在解析復(fù)雜的基因組結(jié)構(gòu)方面具有獨特的優(yōu)勢,。自適應(yīng)采樣則是一種實時動態(tài)調(diào)整采樣率的方法,,使得采集的樣本更具有代表性。
研究人員分析了28個兒童白血病病例的基因組數(shù)據(jù),,以驗證其有效性,。結(jié)果顯示,28個病例中有24例檢測出了重要基因組變異,,其中12個病例是以往方法難以檢測出的基因組結(jié)構(gòu)異常,。此外,以往測序技術(shù)耗時長,,從提交樣本到結(jié)果返回需要超過一個月時間,,而新的基因組分析法72小時就能獲得結(jié)果。
公報說,,本項研究構(gòu)建的分析方法應(yīng)用范圍廣泛,,還能用于藥物代謝相關(guān)的基因詳細(xì)分析,還可檢測出可成為治療效果指標(biāo)的基因組變化,。不過,,與現(xiàn)有測序技術(shù)相比,自適應(yīng)采樣在檢測單核苷酸變異、小片段基因的插入和缺失方面并不具備優(yōu)勢,。研究人員計劃通過完善分析軟件等方法提高成功率,。
本項研究相關(guān)成果已發(fā)表于新一期《血癌雜志》上。
(記者錢錚)
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