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新華社杭州6月26日電(記者朱涵)杭州華大生命科學(xué)研究院與南方科技大學(xué)創(chuàng)建了一個解碼動物發(fā)育過程的多模態(tài)數(shù)據(jù)集,生成了果蠅全發(fā)育周期的3D單細(xì)胞時空多組學(xué)圖譜,,為生物發(fā)育提供了分子層面的參考,,有望為發(fā)育缺陷及相關(guān)疾病機(jī)制研究奠定基礎(chǔ)。相關(guān)成果26日發(fā)表于國際學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》,。
研究人員介紹,,動物發(fā)育是基因與細(xì)胞在時空維度上精密協(xié)作的復(fù)雜過程。以果蠅為例,,其發(fā)育的過程,,大體需要經(jīng)過卵、幼蟲,、蛹和成蟲4個階段,。如果說這個成長過程,是一場精密編排的“生命舞臺劇”,,那么每個細(xì)胞何時何地“登場”、如何變成特定的細(xì)胞類型,,便都是由基因“劇本”調(diào)控的,。
研究團(tuán)隊基于華大自主研發(fā)技術(shù),對果蠅胚胎每0.5至2小時,、幼蟲及蛹期的各個關(guān)鍵階段進(jìn)行采樣,,生成超過380萬個空間分辨的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組,并利用“Spateo”算法工具重建出高精度3D模型,精準(zhǔn)解析組織形態(tài)與基因表達(dá)的空間動態(tài),。通過整合數(shù)據(jù),,進(jìn)一步構(gòu)建了果蠅胚胎發(fā)育的“分化軌跡地圖”,解析了細(xì)胞命運(yùn)決定的關(guān)鍵分子機(jī)制,。
“研究發(fā)現(xiàn),,不同胚層的細(xì)胞會沿著特定路徑分化,轉(zhuǎn)錄因子就像‘導(dǎo)演’,,通過激活或抑制基因,,指揮細(xì)胞扮演特定角色�,!蔽恼鹿餐谝蛔髡�,、杭州華大生命科學(xué)研究院專項科學(xué)家王明月說,研究發(fā)現(xiàn)多個此前未被鑒定的轉(zhuǎn)錄因子,,在神經(jīng),、腸道及內(nèi)分泌系統(tǒng)中可能起關(guān)鍵作用。
王明月表示,,果蠅與人類共享約70%的疾病相關(guān)基因,,理解其發(fā)育過程及基因調(diào)控機(jī)制,能夠幫助我們更好地探究生命發(fā)育等重要科學(xué)問題,,并為人類發(fā)育疾病領(lǐng)域相關(guān)研究提供參考,。
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新華社杭州6月26日電(記者朱涵)杭州華大生命科學(xué)研究院與南方科技大學(xué)創(chuàng)建了一個解碼動物發(fā)育過程的多模態(tài)數(shù)據(jù)集,,生成了果蠅全發(fā)育周期的3D單細(xì)胞時空多組學(xué)圖譜,,為生物發(fā)育提供了分子層面的參考,有望為發(fā)育缺陷及相關(guān)疾病機(jī)制研究奠定基礎(chǔ),。相關(guān)成果26日發(fā)表于國際學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》,。
研究人員介紹,動物發(fā)育是基因與細(xì)胞在時空維度上精密協(xié)作的復(fù)雜過程,。以果蠅為例,,其發(fā)育的過程,大體需要經(jīng)過卵,、幼蟲,、蛹和成蟲4個階段。如果說這個成長過程,,是一場精密編排的“生命舞臺劇”,,那么每個細(xì)胞何時何地“登場”、如何變成特定的細(xì)胞類型,,便都是由基因“劇本”調(diào)控的,。
研究團(tuán)隊基于華大自主研發(fā)技術(shù),對果蠅胚胎每0.5至2小時,、幼蟲及蛹期的各個關(guān)鍵階段進(jìn)行采樣,,生成超過380萬個空間分辨的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組,并利用“Spateo”算法工具重建出高精度3D模型,,精準(zhǔn)解析組織形態(tài)與基因表達(dá)的空間動態(tài),。通過整合數(shù)據(jù),進(jìn)一步構(gòu)建了果蠅胚胎發(fā)育的“分化軌跡地圖”,,解析了細(xì)胞命運(yùn)決定的關(guān)鍵分子機(jī)制,。
“研究發(fā)現(xiàn),不同胚層的細(xì)胞會沿著特定路徑分化,,轉(zhuǎn)錄因子就像‘導(dǎo)演’,,通過激活或抑制基因,指揮細(xì)胞扮演特定角色,�,!蔽恼鹿餐谝蛔髡摺⒑贾萑A大生命科學(xué)研究院專項科學(xué)家王明月說,,研究發(fā)現(xiàn)多個此前未被鑒定的轉(zhuǎn)錄因子,,在神經(jīng)、腸道及內(nèi)分泌系統(tǒng)中可能起關(guān)鍵作用,。
王明月表示,,果蠅與人類共享約70%的疾病相關(guān)基因,理解其發(fā)育過程及基因調(diào)控機(jī)制,,能夠幫助我們更好地探究生命發(fā)育等重要科學(xué)問題,,并為人類發(fā)育疾病領(lǐng)域相關(guān)研究提供參考。
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